Model R9 si zachovává mnoho konstrukčních prvků inspirovaných MotoGP. Skvělý tříválcový motor, odpružení na úrovni R1, fantastické přední brzdy Brembo Stylema, velmi lehký hliníkový rám a dokonalý podvozek KYB.
Agresivní styl a aerodynamika dělají z modelu R9 dosud nejúčinnější aerodynamický model Yamaha. Křidýlka dla ve stylu MotoGP snižují vztlak přední části a zlepšují kontakt s vozovkou v kombinaci s nově navrženými komponenty odpružení KYB, které byly nastaveny speciálně pro model R9 a vyvinuty společně s modelem R1 RACE.
Srdcem modelu R9 je oceňovaný tříválcový motor Yamaha CP3 s objemem 890 cm. Jízdní vlastnosti posouvá na další úroveň elektronicky řízená škrticí klapka Yamaha (YCCT), která zajišťuje plynulou odezvu a dokonalou kontrolu jak na silnici, tak na závodní dráze.
Rám z gravitačně litého hliníku ve stylu Deltaboxu byl vyvinut speciálně pro model R9. Hmotnost rámu 9,7 kg z něj dělá nejlehčí rám, jaký kdy byl použit pro model Yamaha Supersport.
Dokonalá aerodynamická kapotáž, vybavena křidélky která snižují vztlak předního kola v přímém směru o 6–7 % a v kombinaci s předním spoilerem pod M-kanálem se tento účinek při průjezdu zatáčkou zvyšuje na přibližně 10 %
Model R9 je vybaven závodními monoblokovými třmeny Brembo Stylema, opletenými brzdovými hadičkami nerezovou ocelí a velkými předními kotouči o průměru 320 mm
Nová 43mm přední vidlice upside down KYB je vybavena regulátory odskoku a kompresním tlumením na levém a pravém tlumiči. Každou z nich lze nastavit samostatně, přičemž pravý tlumič ovládá tlumení odskoku a levý tlumič kompresi. U zadního tlumiče lze nastavit předpětí, tlumení odskoku, kompresní tlumení a světlou výšku.
K dispozici máte tři integrované jízdní režimy „Sport“, „Street“ a „Rain“ s továrním nastavením s různými úrovněmi pro různé podmínky doplňuje možnost přednastavit dva vlastní režimy a čtyři režimy Track.
Šestiosá jednotka IMU přenáší data v reálném čase a podporuje asistenci pro jezdce citlivou na náklon včetně kontroly trakce, kontroly skluzu a kontroly brzd.
K dispozici máte čtyři výkonové režim, režim zvedání předního kola a režim startu.
Plnobarevný displej se čtyřmi tématy lze propojit s chytrým telefonem.
R9 je pně vybavená na sportovní ježdění, vč. rychlořazení, stavitelných páček, lehkých kol aj.